Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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