Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn20G5E8X0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn20G5E8X0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn20G5E8X0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn20G5E8X0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn20G5E8X0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn20G5E8X0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cldn20G5E8X0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cldn20G5E8X0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cldn20G5E8X0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn20G5E8X0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Cldn20G5E8X0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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