Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgxb3G3X9M3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms