Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms