Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ercc6F8VPZ5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms