Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gm28038F7BCN9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm28038F7BCN9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm28038F7BCN9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm28038F7BCN9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm28038F7BCN9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm28038F7BCN9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm28038F7BCN9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm28038F7BCN9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm28038F7BCN9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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