Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28048F7BCN0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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