Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox13F6YCR7 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms