Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms