Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms