Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20671F6TVX7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms