Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10477F6SW83 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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