Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc6F2Z461 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms