Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms