Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmod3E9QA62 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms