Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cald1E9QA15 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cald1E9QA15 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cald1E9QA15 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cald1E9QA15 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cald1E9QA15 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cald1E9QA15 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cald1E9QA15 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cald1E9QA15 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cald1E9QA15 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cald1E9QA15 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cald1E9QA15 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cald1E9QA15 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cald1E9QA15 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cald1E9QA15 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cald1E9QA15 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms