Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp17lbE9Q9U0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp17lbE9Q9U0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp17lbE9Q9U0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp17lbE9Q9U0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms