Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U0

Kcnmb3, Potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 3, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb3E9Q7U0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Kcnmb3E9Q7U0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Kcnmb3E9Q7U0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Kcnmb3E9Q7U0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Kcnmb3E9Q7U0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Kcnmb3E9Q7U0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb3E9Q7U0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb3E9Q7U0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb3E9Q7U0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb3E9Q7U0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb3E9Q7U0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb3E9Q7U0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb3E9Q7U0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb3E9Q7U0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb3E9Q7U0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb3E9Q7U0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb3E9Q7U0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb3E9Q7U0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb3E9Q7U0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb3E9Q7U0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb3E9Q7U0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb3E9Q7U0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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