Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms