Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BC005561E9Q5E2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BC005561E9Q5E2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms