Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm20518E9Q548 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20518E9Q548 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm20518E9Q548 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm20518E9Q548 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm20518E9Q548 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm20518E9Q548 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm20518E9Q548 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm20518E9Q548 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm20518E9Q548 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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