Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms