Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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ApobE9Q414 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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ApobE9Q414 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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ApobE9Q414 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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ApobE9Q414 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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ApobE9Q414 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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ApobE9Q414 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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ApobE9Q414 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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ApobE9Q414 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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ApobE9Q414 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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ApobE9Q414 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
ApobE9Q414 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
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