Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc171E9Q1U1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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