Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Zfp558E9Q1J0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Zfp558E9Q1J0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Zfp558E9Q1J0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Zfp558E9Q1J0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Zfp558E9Q1J0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Zfp558E9Q1J0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Zfp558E9Q1J0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Zfp558E9Q1J0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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