Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930426L09RikE9Q0N7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930426L09RikE9Q0N7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930426L09RikE9Q0N7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930426L09RikE9Q0N7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4930426L09RikE9Q0N7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930426L09RikE9Q0N7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4930426L09RikE9Q0N7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930426L09RikE9Q0N7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930426L09RikE9Q0N7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930426L09RikE9Q0N7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930426L09RikE9Q0N7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms