Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms