Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdr1E9Q0B4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms