Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc1E9Q043 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms