Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20425E9Q035 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms