Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms