Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms