Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Srp54bE9PXC0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms