Protein–RNA interactions for Protein: E9PWS4

AU018091, Expressed sequence AU018091, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU018091E9PWS4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU018091E9PWS4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms