Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms