Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc144bE9PVZ3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms