Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttc17E9PVB5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms