Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms