Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gcn1E9PVA8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms