Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms