Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms