Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl3E0CZ16 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms