Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms