Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms