Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5930D3Z257 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms