Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm3543D3Z235 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3543D3Z235 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm3543D3Z235 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm3543D3Z235 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm3543D3Z235 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3543D3Z235 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3543D3Z235 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3543D3Z235 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3543D3Z235 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3543D3Z235 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3543D3Z235 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3543D3Z235 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3543D3Z235 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3543D3Z235 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3543D3Z235 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3543D3Z235 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3543D3Z235 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3543D3Z235 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3543D3Z235 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3543D3Z235 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3543D3Z235 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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