Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ5

Tmed7, Transmembrane p24-trafficking protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed7D3YZZ5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed7D3YZZ5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed7D3YZZ5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed7D3YZZ5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed7D3YZZ5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmed7D3YZZ5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed7D3YZZ5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed7D3YZZ5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed7D3YZZ5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed7D3YZZ5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed7D3YZZ5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed7D3YZZ5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed7D3YZZ5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed7D3YZZ5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed7D3YZZ5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed7D3YZZ5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed7D3YZZ5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed7D3YZZ5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed7D3YZZ5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed7D3YZZ5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed7D3YZZ5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms