Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc170D3YXL0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms