Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsperg2C6KI89 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Catsperg2C6KI89 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Catsperg2C6KI89 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Catsperg2C6KI89 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Catsperg2C6KI89 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Catsperg2C6KI89 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Catsperg2C6KI89 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms