Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17333C6EQI3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm17333C6EQI3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms